Для склейки двух доменов нужно в .htaccess вставить следующие строки:
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^oldsite\.com
RewriteRule ^(.*)$ http://newsite.org/$1 [R=301,L]
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www.oldsite\.com
RewriteRule ^(.*)$ http://newsite.org/$1 [R=301,L]
С такими правилами редиректа все страницы, которые в поиске будут правильно открываться на новом домене.
Ну, и в яндекс.вебмастере в разделе “Переезд сайта” указать новый домен.